Основными обязанностями младшего инспектора являются проверка условий содержания и охраны заключенных в учреждениях Федеральной службы исполнения наказаний, а также соблюдения их прав и обязанностей. Он участвует в проведении инструктажей, осуществляет внеплановые проверки, составляет акты о выявленных нарушениях, а также направляет предложения по улучшению и совершенствованию работы учреждений исправительной системы.